Структурных подразделений нет.
Управление Учреждением осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Высшим органом управления Учреждения является Учредитель — Православная религиозная организация Владимирская Епархия Русской Православной Церкви.
Единоличным исполнительным органом Учреждения является директор. Директор осуществляет текущее руководство деятельностью православной гимназии, подотчетен Учредителю. Директор назначается решением Учредителя на срок 5 (пять) лет. В настоящее время директором Православной гимназии г.Коврова является протоиерей Михаил Владимирович Бунтилов.
В Учреждении формируются коллегиальные органы управления:
- Общее собрание работников.
- Педагогический совет.
- Попечительский совет.
- Советы обучающихся.
- Советы родителей.
Членами Общего собрания работников являются все работники, выполняющие трудовую функцию в Учреждении. Общие вопросы решаются Общим собранием работников в соответствии с Положением об Общем собрании работников.
Педагогический совет – коллективный орган управления гимназией, состоящий из педагогических работников , который действует для рассмотрения основных вопросов организации образовательного и воспитательного процессов в гимназии. Педагогический совет несет коллективную ответственность за принятые решения. Педагогический совет осуществляет свою деятельность в соответствии с Положением о Педагогическом совете.
Директор гимназии определяет совместно с педагогическим советом гимназии стратегию развития, представляет её интересы в государственных и общественных инстанциях. Несет персональную юридическую ответственность за организацию жизнедеятельности гимназии, создает благоприятные условия для осуществления образовательного процесса.
В состав Попечительского совета могут входить участники образовательного процесса и иные лица, заинтересованные в совершенствовании деятельности и развитии Учреждения, поддерживающие уставные цели Учреждения и готовые содействовать Учреждению в их реализации. Утверждение персонального и количественного состава Попечительского совета осуществляется Учредителем на 10 лет. Попечительский совет действует в соответствии с Положением о Попечительском совете.
В целях учета мнения обучающихся, родителей (законных представителей несовершеннолетних обучающихся) по вопросам управления православной гимназией и при принятии локальных нормативных актов, затрагивающих их права и законные интересы, по инициативе обучающихся, родителей (законных представителей) в Учреждении могут создаваться ученический совет и родительский совет.
В Учреждении действует Первичная профсоюзная организация работников образования.